Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRG3Q99928 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms