Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms