Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3R4Q99570 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms