Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms