Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EYA1Q99502 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA1Q99502 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms