Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms