Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms