Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms