Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms