Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms