Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms