Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIC2Q96JB3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms