Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms