Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPSB1Q96BD6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms