Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms