Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms