Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN9Q8WX39 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN9Q8WX39 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms