Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms