Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms