Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms