Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms