Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms