Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms