Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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DTX3Q8N9I9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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DTX3Q8N9I9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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DTX3Q8N9I9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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DTX3Q8N9I9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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DTX3Q8N9I9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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DTX3Q8N9I9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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DTX3Q8N9I9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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DTX3Q8N9I9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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