Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms