Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71E2Q8N5Q1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71E2Q8N5Q1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71E2Q8N5Q1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71E2Q8N5Q1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71E2Q8N5Q1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71E2Q8N5Q1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71E2Q8N5Q1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71E2Q8N5Q1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71E2Q8N5Q1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71E2Q8N5Q1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms