Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms