Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTR1Q8N1G2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTR1Q8N1G2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms