Protein–RNA interactions for Protein: Q86V21

AACS, Acetoacetyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AACSQ86V21 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AACSQ86V21 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms