Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms