Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXIP1Q6ZW49 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms