Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms