Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms