Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms