Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms