Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms