Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms