Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms