Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BROXQ5VW32 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BROXQ5VW32 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms