Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms