Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC183Q5T5S1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms