Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms