Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms