Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms