Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms