Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A8Q2Y0W8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms