Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms