Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SPHKAPQ2M3C7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
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