Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms