Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
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PTPRNQ16849 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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PTPRNQ16849 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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PTPRNQ16849 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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PTPRNQ16849 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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PTPRNQ16849 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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